• JAK PRZYGOTOWAĆ MATRYCE?
  
• JAK OPISAĆ MATRYCE?
  
• JAK PRZYSŁAĆ MATRYCE?
  
• JAK DOBRAĆ STARTER?

• Starter: w stężeniu 5 pmol/µl (5 µM), co najmniej 10 µl.
  W przypadku stosowania starterów standardowych, Genomed bezpłatnie dostarcza wybrany starter
  
  
• Ilość DNA zawieszona w wodzie, w objętości nie mniejszej niż 12 µl (minimum) na zlecenie jednego sekwencjonowania:
  
  

  produkt PCR < 500 pz	60 ng
  produkt PCR 500-1000 pz	120 ng
  produkt PCR > 1000 pz	240 ng
  DNA jednoniciowy	60-120 ng
  DNA dwuniciowy, plazmid	240-600 ng
  cosmid, BAC	600-1200 ng



• Stężenie DNA zawieszonego w wodzie, w objętości nie mniejszej niż 12 µl (minimum) na zlecenie jednego sekwencjonowania:
  
  

  produkt PCR < 500 pz	5 ng/µl
  produkt PCR 500-1000 pz	10 ng/µl
  produkt PCR > 1000 pz	20 ng/µl
  DNA jednoniciowy	5-10 ng/µl
  DNA dwuniciowy, plazmid	20-50 ng/µl
  cosmid, BAC	50-100 ng/µl


Produkty PCR oddawane jako matryce do sekwencjonowania powinny zostać oczyszczone ze starterów, dNTP-ów, etc. i zawieszone w wodzie.

• Zdjęcie żelu matrycowego DNA

• Wypełniony formularz do opisu próbek

JAK OPISAĆ MATRYCE?

Zachęcamy do opisywania próbek on-line - 5% rabatu !!! Internetowy formularz opisu próbek gwarantuje, ze nazwy Państwa próbek będą nazwane poprawnie.


Bardzo prosimy o dołączenie opisu dostarczanych próbek, zawierającego:

• nazwę każdej próbki,
• stężenie matrycy lub zdjęcie żelu wraz z informacją ile mikrolitrów naniesiono na żel
• jakiej wielkości jest produktu PCR lub plazmid
• jaką metodę użyto do izolacji DNA
• nazwę startera
• temperaturę annealingu (Tm) startera.
• w przypadku produktów PCR - czy produkt został oczyszczony po reakcji PCR, czy też wymaga oczyszczania

Opis powinien być opatrzony nazwiskiem / instytucją zamawiającego oraz nazwą użytkownika (loginem) z serwisu internetowego Genomedu.

W przypadku przesyłania płytek z przygotowanymi reakcjami lub matrycami prosimy o wypełnienie formularza do opisu płytki , lub przesłanie emailem Adres poczty elektronicznej jest chroniony przed robotami spamującymi. W przeglądarce musi być włączona obsługa JavaScript, żeby go zobaczyć. opisu w formacie csv (Excel)

 
JAK PRZYSŁAĆ MATRYCE?

• Genomed pokrywa koszty przesyłki standardowej (koperty o wadze do 300g, odbiór i nadanie w dni robocze. Nie pokrywamy kosztów usług dodatkowych: Prearranged Delivery, Cash on Delivery, Ubezpieczenie, Priority, Return Document, Saturday Delivery.
• Zalecamy stosowanie kopert z bąbelkami.
• Matryce DNA (produkty PCR, plazmidy) i primery w stężeniu 5µM są stabilne w temperaturze pokojowej przez kilka dni. Jeśli życzą sobie Państwo przysłać próbki z wkładami chłodzącymi - doliczamy różnicę w cenie przesyłki.
• Nadając próbki do sekwencjonowania jako zawartość prosimy podawać: "materiał DNA bezpieczny w transporcie".
  

JAK DOBRAĆ STARTER?

• Optymalna długość startera to 17-25 nt.
• Zdegenerowane startery nie są polecane, aczkolwiek dopuszcza się takie, jeśli ostatnich 8 nukleotydów (3' koniec) jest komplementarnych.
• Temperatura topnienia startera powinna wynosić od 45-60 °C. Przy czym optymalne odczyty uzyskuje się przy temperaturze 52-55 °C.
• Wykonanie reakcji jest utrudnione a nawet może być niewykonalne, jeśli starter tworzy struktury typu szpilki do włosów (hairpin) lub homodimery.

Przed podjęciem decyzji o sekwencjonowaniu zalecamy sprawdzić wybrany starter np. tutaj .
W przypadku stosowania starterów standardowych , Genomed bezpłatnie dostarcza wybrany starter.